일 시 | 2012년 2월 20일(월)- 24일(금)
장 소 | 서울의대 동창회관 3층 가천홀 등록 바로가기
주 관 | 서울의대 정보의학실, 시스템 바이오 정보의학 연구센터 (SBI-NCRC)
주 최 | 대한의료정보학회, 한국생물정보시스템생물학회
Genome Data Analysis Workshop을 개최하며
안녕하십니까?
차 세대 시퀀싱 기술(NGS, Next Generation Sequencing)을 포함한 방대한 유전체 데이터는 대부분의 생명과학자나 의학자에게 다루기도 힘들 뿐 아니라 그 정보처리와 분석, 나아가 의미있는 해석은 참으로 어려운 작업이 되었습니다. 서열정보, 발현정보, 메타-에피지놈 정보, 정보표준 및 분자생물학 데이터베이스와 패스웨이, 온톨로지 등 필요한 학습 주제 목록은 점점 길어져만 갑니다. 이와 같은 시대적 요구에 부응하여 서울의대 정보의학실과 시스템 바이오 정보의학 국가핵심연구센터에서는 초보자도 접근할 수 있는 실용적인 유전체 데이터 분석의 전반적 지식을 예제중심으로 실습하고, 연구와 맞춤의료 및 산업응용을 촉진하기 위한 GDA (Genome Data Analysis) 웍샵을 개설했습니다. 금번은 2011년 첫 웍샵에 이은 두 번째 발걸음입니다. 범문사의 도움으로 2011년 웍샵자료가 단행본으로 발간되는 큰 성과를 얻었습니다. 부디 본 웍샵을 통해 실용적인 유전체 정보 분석의 역량을 강화하는 기회가 되시기를 기대하며 많은 관심과 참여를 부탁드립니다.
2012년 1월, 서울의대 정보의학실장 김 주 한
■ 등 록
등록인원: 하루 강좌 당 50명 내외
참 가 비: 하루 강좌 당 참가비
등록방법: 홈페이지: http://healthavatar.snu.ac.kr/workshop/registration.html에서 등록 신청
1월28일 이전 1월 28일 이후 학 생 60,000 80,000 공공/대학/정부 80,000 100,000 일반(기업등) 120,000 150,000 * 한 사람이 3개의 강좌까지 선택 수강 가능 강의교재 및 중식 제공 ■ 준비사항 실습을 위한 참가자 전원 개인 노트북 컴퓨터 준비 ■ 문의처 담당자: 정혜림 E-mail: jeong225@snu.ac.kr DAY 1: Advanced Microarray Data Analysis & miRNAs 강좌 I (2월 20일): 시간 주 제 강 사 8:30 ~ 9:20 등록 및 사전 프로그램 설치 9:20 ~ 9:40 Advanced Microarray Data Analysis & miRNAs 9:40 ~ 10:30 Gene Expression Analysis 김주한 교수 10:40 ~ 12:00 실 습 I: t-test, SAM, ANOVA, FDR 나영지, 이수연s 12:00 ~ 13:00 중 식 13:00 ~ 13:50 Gene-set Approaches 조성범 박사 14:00 ~ 15:20 실 습 II: Gene Set Enrichment Analysis Cox-PH, Log Rank Test 김도균, 서희원 15:40 ~ 16:30 miRNA Sequence & Functional Analysis 김완규 교수 16:40 ~ 18:00 실 습 III: miRNA target prediction 이수연, 백수연 DAY 2: Next Generation Sequencing & Personal Genome Data 강좌 II (2월 21일): 시간 주 제 강 사 8:30 ~ 9:20 등록 및 사전 프로그램 설치 9:20 ~ 9:40 Next Generation Sequencing & Personal Genome Data Analysis 9:40 ~ 10:30 NGS Platforms and Applications 이환석 박사 10:40 ~ 12:00 실 습 I: NGS Data Processing 나영지, 윤선민 12:00 ~ 13:00 중 식 13:00 ~ 13:50 Exome Sequencing Analysis 이종은 박사 14:00 ~ 15:20 실 습 II: SNP and Indel Identification 박찬희, 서희원 15:40 ~ 16:30 Personal Genome Interpretation 김지훈 박사 16:40 ~ 18:00 실 습 III: Personal Genome Reports with 권창혁, 윤준희 DAY 3: Network Biology, Sequence, Pathway & Ontology Informatics 강좌 III (2월 22일) 시간 주 제 강 사 8:30 ~ 9:20 등록 및 사전 프로그램 설치 9:20 ~ 9:40 Network Biology, Sequence, Pathway & Ontology Informatics 9:40 ~ 10:30 Motif and Regulatory Sequence Analysis 최선심 교수 10:40 ~ 12:00 실 습 I: TF Target Prediction 정희준, 조용래 12:00 ~ 13:00 중 식 13:00 ~ 13:50 Molecular Pathway & Gene Ontology 김양석 교수 14:00 ~ 15:20 실 습 II: Pathway, Gene Ontology Analysis 정희준, 백수연 15:40 ~ 16:30 Biological Network Analysis 이기영 교수 16:40 ~ 18:00 실 습 III: Gene Regulatory Networks 한현욱, 윤선민 DAY 4: SNPs, GWAS & CNVs: Informatics for Variations 강좌 IV (2월 23일): 시간 주 제 강 사 8:30 ~ 9:20 등록 및 사전 프로그램 설치 9:20 ~ 9:40 SNPs, GWAS & CNVs: Informatics for Variations 9:40 ~ 10:30 SNP Data Analysis 박지완 교수 10:40 ~ 12:00 실 습 I: Haplotype Estimation, LD Blocking 김도균, 윤준희 12:00 ~ 13:00 중 식 13:00 ~ 13:50 GWAS Data Analysis 이종극 교수 14:00 ~ 15:20 실 습 II: GWAS Data Processing 박찬희, 조용래 15:40 ~ 16:30 CNV Data Analysis 김봉조 박사 16:40 ~ 18:00 실 습 III: Identification of CNV Regions 김도균, 서희원 DAY 5: RNA-seq, Disease Genome, Meta-& Epigenome Data 강좌 V (2월 24일) 시간 주 제 강 사 8:30 ~ 9:20 등록 및 사전 프로그램 설치 9:20 ~ 9:40 RNA-seq, Disease Genome, Meta-& Epigenome Data Analysis 9:40 ~ 10:30 RNA-Seq Whole Transcriptome Data Analysis 정제균 박사 10:40 ~ 12:00 실 습 I: Transcript Assembly 이수연, 이수연s 12:00 ~ 13:00 중 식 13:00 ~ 13:50 Rare & Cancer Disease Genome Informatics 김남신 박사 14:00 ~ 15:20 실 습 II: Identifying Genomic Rearrangement Gene Fusion Analysis from RNA-seq 이수연s, 백수연 15:40 ~ 16:40 Meta- & Epigenome Data Analysis 김 선 교수 16:40 ~ 18:00 실 습 III: DNA Management and Analysis for 한현욱, 윤선민 교육장소 | 서울의대 동창회관 3층 가천홀, 서울시 종로구 연건동 28 교 통 | 지하철 4호선 혜화역 3번 출구 이용
강의대상: 대규모 유전체 데이터 분석과 응용에 관심 있는 BT, IT, 혹은 의학 분야 전공자
환불규정: 2월 6일 이전 취소: 전액 반환
워크샵 2주 이전 (1월 28일 ~ 2월 4일) 취소: 50% 환불
2월 4일 이후: 환불 불가
등록 신청 후 3일 (공휴일, 주말을 제외하고) 이내에 아래의 계좌로 입금해 주십시오.
(신한은행: 140-009-295568 / 예금주: <사>대한의료정보학회 )
R (http://www.r-project.org/), Bioconductor (http://www.bioconductor.org/)
전화: 02-740-8320, 팩스: 02-747-8928,
홈페이지: http://healthavatar.snu.ac.kr/workshop/
- Differential Expression Analysis
- Clustering Analysis
- Classification Analysis
(서울의대)
KNN, SOM, Graph-based Algorithms
LDA, DTs, SVMs
- Gene Set Database
- Gene Set Enrichment Analysis
- Prognostic Subgroup Prediction
(국립보건연구원)
- Post-transcriptional Regulation Analysis
- miRNA Identification
- miRNA Target Prediction
(이화여대)
Functional annotation
GO Enrichment Analysis
Analysis
Current NGS Platforms
- NGS Data Formats
- NGS Data Analysis Technologies
- NGS Applications
(마크로젠)
NGS Sequence Alignment
NGS Visualization Tools
- Exome Sequencing Data
- Exome Sequencing of Rare Disease
- Variant Analysis and Annotation
(DNA Link)
Variant Analysis and Annotation
- Phenotype Annotation
- Genetic Risk Prediction
- Healthcare Application
(서울의대)
Promethease, 1000 genome analysis
Pharmacogenomic Variant Annotation
- Motif Analysis
- Genome Sequence Analysis
- Genome Browser
(강원대)
Phylogenetic Analysis (ClustalW &
TreeView)
UCSD Genome Browser
- Pathway Database and Tools
- Gene Ontology Database and Tools
- Biological Literature and Text Mining
(경희대)
BioLattice, David, Biological Text Mining
- Characteristics of Biological Network
- Protein-protein Interaction Network Analysis
- Regulatory Network Analysis
(아주대)
Biological Network Properties
Network Visualization
- Linkage Disequilibrium Analysis
- Haplotype Estimation
- LD Blocking, Tagging SNPs Selection
(한림대)
dbSNP Database, PharmGKB
- Genotype & Haplotype
- Rare Variant Analysis
- Runs of Homozygosity (ROH)
- Regression-based Testing
(울산의대)
GWAS test with PLINK software
- CNV in Diseases
- CNV Database
- Data Processing
- Copy Number Detection
(국립보건연구원)
CNV Association Testing
Analysis
- Novel Transcript Discovery
- Alternative Splicing Identification
- RNA-editing Analysis
- Differentially Expressed Genes Identification
(서울의대)
RNA-Seq Gene Expression Analysis
- Identifying Genomic Rearrangement
- Gene Fusion Analysis
- Rare Disease Analysis
(생명공학연구원
KOBIC)
Rare Disease Knowledgebaseq
- Comprehensive Analysis of
Metagenomics Data
- Epigenetic Mechanisms
- DNA methylation Analysis
- Histone Modification Analysis
(서울대)
Metagenomes
Epigenome Tools & Databases
- 첨부
-
- biomed.jpg (7.1KB)
- gda.jpg.jpg (152.8KB)
- kosmi.jpg (5.0KB)
- ksbsb.jpg (6.1KB)
- map.jpg (73.7KB)
- NCRC.jpg (12.1KB)
- 학회로고2-진한글씨.jpg (98.8KB)
목록
| 번호 | 제목 | 글쓴이 | 날짜 | 조회 수 |
|---|---|---|---|---|
| 74 |
제 6 회 마이크로어레이 통계 분석 워크샵
|
2012-02-06 | 92 | |
| 73 |
제7회 KOBIC 차세대 생명정보학 교육 워크샵
|
2012-01-27 | 189 | |
| 72 |
유전체 데이터 분석 워크샵(Genome Data Analysis Workshop2012)
|
2012-01-05 | 377 | |
| 71 |
제6회 KOBIC 차세대 생명정보학 교육 워크샵
|
2011-11-29 | 629 | |
| 70 |
한국생물정보시스템생물학회 로고 선정 이벤트1
|
2011-11-08 | 759 | |
| 69 |
학회 회원 재정비 "홈페이지에 회원가입 해주세요" |
2011-11-08 | 674 | |
| 68 |
GIW2011 Poster Submission Deadline Extended to Nov. 15 |
2011-11-04 | 668 | |
| 67 |
GIW 2011 / BIOINFO 2011
|
2011-10-26 | 845 | |
| 66 |
GIW2011 Poster Submission Deadline Extended to Oct. 31 |
2011-10-18 | 1018 | |
| 65 |
시스템 바이오 정보의학 국제학술대회
|
2011-10-07 | 1123 |
0 댓글